总体规划分为四个阶段建设：

　　第一阶段：2009年~2017年，建设合肥地铁1号线、合肥地铁2号线，形成“十”字形的基本骨架;

　　第二阶段：2014年~2020年，建设合肥地铁3号线、合肥地铁4号线、合肥地铁5号线，与合肥地铁1号线、合肥地铁2号线共同形成以主城区为中心向外围组团放射的基本骨架网络，基本覆盖了中心城区的主要客流走廊;

　　第三阶段：2020年~2025年，在骨架网络基础上，建设合肥地铁6号线、合肥地铁7号线、合肥地铁机场线即8号线，在中心城区范围内形成完善的城市轨道交通线网。

　　第四阶段：2025年后，建设合肥地铁9号线-合肥地铁12号线及扩展延伸线，实现线网规划的远景目标。

　　12条地铁线路布局

　　合肥地铁1号线中滨湖新区锦绣大道站(含)至云谷路站(不含)，完成四站四区间土建工程，全长4.404公里。车站设计为地下负一层侧式站。 1号线是一条南北方向的骨干线，北起新蚌埠路与汤池路交叉口北侧，终点在滨湖新区规划的广西路与遵义路交叉路口东侧，全线长28.75公里，全部为地下线，共设置车站23座，其中五座换乘枢纽，项目总投资184亿元(含预留工程)。该线路覆盖主要客流走廊，联接合肥新站地区、老城区、新合肥站枢纽地区、滨湖新区北部次中心、滨湖新区启动区、滨湖新区CBD，为主城区与滨湖新区提供快速联系，预计在2016年底开通运营。

　　2号线是一条东西方向的骨干线，联系老城区、高新区、科学城，引导和促进高新区和科学城的发展。西起长江西路与长宁大道交叉口东侧，终点在长江东路与大众路交叉口西侧。全线长30.06公里，共设置车站24座，全为地下线，其中有五座换乘枢纽，项目总投资145.31亿元。2012年12月，国家发展改革委批准了合肥市轨道交通2号线可行性研究报告。2013年2月19日零点，合肥市轨道交通2号线潜山路站正式封闭施工，标志着合肥市轨道交通2号线正式开工建设，建设工期4年零5个月。

　　1号线、2号线仅仅是合肥市轨道交通建设的一个开端，未来的合肥轨道交通将会四通八达。 据合肥市在2013年8月前公布的轨道交通远景、远期和2013年规划，合肥市轨道交通远景线网总长322.5公里，其中市区线路7条，全长215.3公里;市域线5条(含1条机场专用线)，全长107.2公里。远期中心城区轨道交通规划方案由6条城市轨道交通线路组成，共设置了15个轨道交通枢纽，其中有两个为城市轨道交通与铁路换乘的综合枢纽，全长181.1公里。

　　3号线为东北—西南方向的直径线，联系大学城、蜀山区(政务区)、森林公园、职教城。

　　4号线位于主城区南部，东西走向并联系东、西部组团，呈“L”形，联系科学城、高新区、蜀山区(政务区)、合肥高铁站。

　　5号线为南北走向，将与北门换乘枢纽衔接，连接北、西部城镇密集带，支撑中心城区、西部沿线特别是政务区和滨湖新区的区域连接。远景规划方案中，

　　6号线主要连接主城区与东部组团;

　　7号线将连接滨湖新区、北部次中心、经开区中心和科学城中心;

　　8号线在与5号线衔接基础上，向北部组团延伸;

　　9号线则与2号线衔接，向东部组团延伸;

　　10号线则主要连接滨湖新区、西南组团和东部组团;

　　11号线连接机场和主城区。